Världsarvet, byggt på en ö i mitten av en lagun i nordöstra Italien, besöks av miljontals turister varje år som är ivriga att flyta nerför Canal Grande i en gondolier.
Den berömda staden riskerar redan att sjunka i havet på grund av sättningar och stigande havsnivåer.
Men det senaste hotet mot Venedig handlar mer om ekonomi.
Italienska myndigheter vill bygga en stor utskeppningshamn på lagunens inre sida som gör att fler kryssningsfartyg och massiva containrar kan ta sig förbi den lågt belägna ön.
I en rapport till den italienska regeringen krävde Venedigs hamnmyndighet en ny terminal vid Marghera Port för att hantera ökningen av turism och handel till området. Myndigheten vill också lägga miljoner på att fördjupa farlederna i lagunen.
Naturvårdare säger att det kan bli en "ekologisk katastrof" för Venedig eftersom den ständiga muddringen av lagunen får havsnivån att stiga.
I en rapport som lanserades vid Royal Institute of British Architects sa välgörenhetsorganisationen Venice in Peril att vågor som genereras av stora fartyg och strömmarna som rinner genom de djupa passagerna spelar en stor roll i att dra ut sandbankarna som håller havsvatten ute.
Rapporten, skriven i samarbete med Cambridge University Department of Architecture, säger att byggnader redan förstörs när havsvatten kommer in i tegelverket och sedan skadar infrastrukturen när vattnet torkar ut och lämnar salt kvar. Om nivåerna fortsätter att stiga kan många kända byggnader som Markusplatsen falla sönder helt.
Nicky Baly från Venedig i Peril sa att stigande havsnivåer redan orsakar problem för de flesta av de berömda byggnaderna i staden.
"Lagunens försämring bidrar till att den långsiktiga stigande havsnivån äter in i byggnadernas tegelverk. I slutändan kommer de att falla sönder eftersom strukturerna inte kommer att kunna stå, sa hon.
Venedig är en av de mest trafikerade turistplatserna i världen med mer än 16 miljoner besökare varje år. År 2005 kom 510 kryssningsfartyg upp till 16 däck höga till staden, jämfört med bara 200 år 2000.
Samtidigt dör den petrokemiska industrin i området och den italienska regeringen är angelägen om att främja turism och handel med framväxande marknader på Balkan och Östeuropa.
Venedigs hamnmyndighet insisterade på att det var nödvändigt att förbättra Margheras hamn för att hantera det ökande flödet av turister och varor.
Myndigheten sa att staden kommer att vara säker på grund av ett nytt tidvattenbarriärsystem på 3.7 miljarder pund, känt som MOSE, som förväntas vara i drift 2014, som kommer att stoppa översvämningarna.
Men Tom Spencer, chef för Cambridge University Coastal Research Department, sa att barriären bara kommer att stoppa tidvatten översvämningar och göra lite för att förhindra höjning av havsnivån på grund av kontinuerlig muddring.
”Det är svårt att se hur implementeringen av MOSE-systemet legitimerar fördjupningen av navigationskanalerna i Venediglagunen för närvarande. MOSE är ett extremt översvämningskontrollsystem men problemen i lagunen är relaterade till den långsiktiga evolutionära tendensen”, sa han.
