Genegoggle avslöjar de fysikaliska egenskaperna för kromatin (3D-DNA-veckning) hos celler som härrör från diffusa intrinsic pontine gliom (DIPG). Det nuvarande arbetet är inriktat på att hitta DNA-DNA-kontakter som kan användas som celltypsmarkörer för att karakterisera DIPG-celler och som läkemedelsleveransmål. Michał Marzęcki, Chief Technical Officer, förklarade att "det här är ytterligare en viktig milstolpe som bekräftar riktigheten av vår lösning och ökar vårt värdeförslag".
Ett av kännetecknen för DIPG är en mutation i histon H3.3 som leder till förändring av aminosyran lysin till metionin (K27M), vilket påverkar epigenetiska processer. Genegoggle har framgångsrikt identifierat dussintals DNA-DNA-kontakter (aka DNA-loopar) exklusiva för DIPG-celler som bär på K27M-mutationen och förändringar i H3K27me3-profilen jämfört med normala celler. Genom att använda banbrytande epigenetisk teknologi har många av dessa DNA-loopar kopplats till differentiellt genuttryck och differentiell kromatintillgänglighet.
"Dessa resultat informerar oss om flera histonmodifieringsprofiler för att bättre beskriva kromatintillstånd hos DIPG-celler, vilket gör att vi kan identifiera nya egenskaper och kliniska mål", säger Jakub Mieczkowski, PhD, och Chief Executive Officer. Uppgifterna erhölls under Illumina Accelerator-samarbetet och i samarbete med Prof. Jacek Majewski från McGill University. På frågan om Genegoggles framtid sa Chief Business Officer Marcin Kruczyk, PhD, "vi tror att vi är starkt positionerade för nästa omgång av insamling för att ta denna resa framåt".
Om diffust intrinsic pontine gliom (DIPG)
Diffus intrinsic pontine gliom är den vanligaste typen av pediatrisk hjärnstamcancer. Medianöverlevnaden för barn med DIPG är mindre än ett år från diagnos, och liten förbättring av överlevnaden har uppnåtts på decennier. Den nuvarande diagnosmetoden är MRT-undersökning (magnetisk resonanstomografi) och sker vanligtvis när symtomen är långt framskridna. Ett genetiskt kännetecken för DIPG är en mutation i genen H3F3A som kodar för histon H3.3.
VAD MAN TA BORT FRÅN DENNA ARTIKEL:
- A genetic hallmark of DIPG is a mutation in the gene H3F3A that encodes histone H3.
- Genegoggle has successfully identified dozens of DNA-DNA contacts (aka DNA loops) exclusive to DIPG cells carrying the K27M mutation and changes in the H3K27me3 profile when compared with normal cells.
- One of the hallmarks of DIPG is a mutation in histone H3.
